Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP43Q8NFH3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP43Q8NFH3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP43Q8NFH3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP43Q8NFH3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP43Q8NFH3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms