Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID1BQ8NFD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID1BQ8NFD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID1BQ8NFD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID1BQ8NFD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID1BQ8NFD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID1BQ8NFD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID1BQ8NFD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms