Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF555Q8NEP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF555Q8NEP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF555Q8NEP9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms