Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF1Q8NEP3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF1Q8NEP3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF1Q8NEP3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms