Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46DQ8NEK8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46DQ8NEK8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM46DQ8NEK8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM46DQ8NEK8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM46DQ8NEK8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms