Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE00

TMEM104, Transmembrane protein 104, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM104Q8NE00 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM104Q8NE00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM104Q8NE00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms