Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNLDC1Q8NA58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNLDC1Q8NA58 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNLDC1Q8NA58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms