Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLAQ8IXN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLAQ8IXN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms