Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms