Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHERPQ8IWX8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHERPQ8IWX8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHERPQ8IWX8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHERPQ8IWX8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHERPQ8IWX8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms