Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD2Q8IV50 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LYSMD2Q8IV50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD2Q8IV50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms