Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC190Q86UF4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC190Q86UF4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC190Q86UF4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC190Q86UF4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms