Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP1Q6WKZ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP1Q6WKZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms