Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANBP10Q6VN20 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RANBP10Q6VN20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANBP10Q6VN20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANBP10Q6VN20 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANBP10Q6VN20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RANBP10Q6VN20 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANBP10Q6VN20 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANBP10Q6VN20 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RANBP10Q6VN20 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms