Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC137Q6PK04 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC137Q6PK04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC137Q6PK04 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC137Q6PK04 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms