Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CSAG1Q6PB30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CSAG1Q6PB30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CSAG1Q6PB30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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