Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF549Q6P9A3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF549Q6P9A3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF549Q6P9A3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF549Q6P9A3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms