Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK5Q6P3R8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK5Q6P3R8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK5Q6P3R8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK5Q6P3R8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK5Q6P3R8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK5Q6P3R8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK5Q6P3R8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK5Q6P3R8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms