Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCN10Q6JVE6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN10Q6JVE6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN10Q6JVE6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCN10Q6JVE6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCN10Q6JVE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms