Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GRAMD4Q6IC98 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRAMD4Q6IC98 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD4Q6IC98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GRAMD4Q6IC98 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD4Q6IC98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms