Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBS0

TWF2, Twinfilin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF2Q6IBS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TWF2Q6IBS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TWF2Q6IBS0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWF2Q6IBS0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWF2Q6IBS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TWF2Q6IBS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWF2Q6IBS0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TWF2Q6IBS0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms