Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR4

OTP, Homeobox protein orthopedia, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTPQ5XKR4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTPQ5XKR4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTPQ5XKR4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTPQ5XKR4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTPQ5XKR4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTPQ5XKR4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms