Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF9Q5VWM5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF9Q5VWM5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF9Q5VWM5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF9Q5VWM5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF9Q5VWM5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms