Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC181Q5TID7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC181Q5TID7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC181Q5TID7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC181Q5TID7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms