Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP40Q5TG30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGAP40Q5TG30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP40Q5TG30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP40Q5TG30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP40Q5TG30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP40Q5TG30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP40Q5TG30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP40Q5TG30 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP40Q5TG30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms