Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIF1Q5T3J3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIF1Q5T3J3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIF1Q5T3J3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIF1Q5T3J3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms