Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PERM1Q5SV97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PERM1Q5SV97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PERM1Q5SV97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms