Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47A1Q5JQC4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47A1Q5JQC4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47A1Q5JQC4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47A1Q5JQC4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47A1Q5JQC4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms