Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP13A4Q4VNC1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP13A4Q4VNC1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP13A4Q4VNC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP13A4Q4VNC1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP13A4Q4VNC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP13A4Q4VNC1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms