Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1BQ3KR37 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1BQ3KR37 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1BQ3KR37 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRAMD1BQ3KR37 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1BQ3KR37 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1BQ3KR37 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms