Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms