Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU2Q2VPK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTU2Q2VPK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTU2Q2VPK5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU2Q2VPK5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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