Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
FHOD3Q2V2M9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
FHOD3Q2V2M9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
FHOD3Q2V2M9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
FHOD3Q2V2M9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
FHOD3Q2V2M9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
FHOD3Q2V2M9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
FHOD3Q2V2M9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
FHOD3Q2V2M9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
FHOD3Q2V2M9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms