Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTL8BQ17RB0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTL8BQ17RB0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTL8BQ17RB0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTL8BQ17RB0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms