Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTF1Q16619 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTF1Q16619 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTF1Q16619 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTF1Q16619 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTF1Q16619 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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