Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
E2F4Q16254 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
E2F4Q16254 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
E2F4Q16254 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
E2F4Q16254 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
E2F4Q16254 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E2F4Q16254 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
E2F4Q16254 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
E2F4Q16254 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E2F4Q16254 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms