Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RYR3Q15413 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RYR3Q15413 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYR3Q15413 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYR3Q15413 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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