Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR6A1Q15406 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR6A1Q15406 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR6A1Q15406 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR6A1Q15406 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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