Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC43.06■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
EEA1Q15075 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
EEA1Q15075 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
EEA1Q15075 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
EEA1Q15075 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
EEA1Q15075 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
EEA1Q15075 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
EEA1Q15075 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
EEA1Q15075 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms