Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA0040Q15053 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA0040Q15053 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA0040Q15053 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA0040Q15053 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA0040Q15053 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms