Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA9Q13797 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA9Q13797 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA9Q13797 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA9Q13797 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA9Q13797 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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