Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGA9Q13797 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGA9Q13797 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGA9Q13797 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGA9Q13797 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGA9Q13797 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGA9Q13797 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGA9Q13797 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGA9Q13797 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGA9Q13797 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ITGA9Q13797 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGA9Q13797 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ITGA9Q13797 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGA9Q13797 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGA9Q13797 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGA9Q13797 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGA9Q13797 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGA9Q13797 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGA9Q13797 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGA9Q13797 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGA9Q13797 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITGA9Q13797 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITGA9Q13797 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGA9Q13797 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGA9Q13797 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGA9Q13797 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGA9Q13797 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGA9Q13797 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGA9Q13797 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGA9Q13797 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGA9Q13797 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGA9Q13797 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGA9Q13797 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGA9Q13797 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGA9Q13797 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA9Q13797 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGA9Q13797 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGA9Q13797 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGA9Q13797 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA9Q13797 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA9Q13797 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGA9Q13797 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA9Q13797 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA9Q13797 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA9Q13797 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA9Q13797 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGA9Q13797 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGA9Q13797 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGA9Q13797 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGA9Q13797 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA9Q13797 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGA9Q13797 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA9Q13797 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA9Q13797 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA9Q13797 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA9Q13797 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA9Q13797 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA9Q13797 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGA9Q13797 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGA9Q13797 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGA9Q13797 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGA9Q13797 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGA9Q13797 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA9Q13797 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA9Q13797 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA9Q13797 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA9Q13797 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA9Q13797 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA9Q13797 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA9Q13797 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA9Q13797 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA9Q13797 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITGA9Q13797 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA9Q13797 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA9Q13797 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA9Q13797 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA9Q13797 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA9Q13797 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA9Q13797 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA9Q13797 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA9Q13797 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA9Q13797 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGA9Q13797 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGA9Q13797 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA9Q13797 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA9Q13797 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGA9Q13797 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGA9Q13797 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA9Q13797 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA9Q13797 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA9Q13797 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA9Q13797 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA9Q13797 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA9Q13797 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGA9Q13797 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA9Q13797 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA9Q13797 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA9Q13797 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA9Q13797 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA9Q13797 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms