Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SGCGQ13326 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCGQ13326 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SGCGQ13326 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGCGQ13326 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGCGQ13326 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
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