Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN1Q12860 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN1Q12860 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN1Q12860 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTN1Q12860 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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