Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGCS1Q01581 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCS1Q01581 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGCS1Q01581 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGCS1Q01581 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms