Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPM4P67936 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPM4P67936 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPM4P67936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPM4P67936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPM4P67936 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPM4P67936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPM4P67936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM4P67936 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM4P67936 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM4P67936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM4P67936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM4P67936 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPM4P67936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM4P67936 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM4P67936 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM4P67936 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM4P67936 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM4P67936 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM4P67936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM4P67936 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM4P67936 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM4P67936 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM4P67936 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM4P67936 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM4P67936 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPM4P67936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPM4P67936 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM4P67936 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM4P67936 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM4P67936 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM4P67936 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPM4P67936 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TPM4P67936 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPM4P67936 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPM4P67936 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM4P67936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM4P67936 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM4P67936 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM4P67936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPM4P67936 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPM4P67936 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPM4P67936 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TPM4P67936 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPM4P67936 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPM4P67936 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPM4P67936 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPM4P67936 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPM4P67936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPM4P67936 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM4P67936 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM4P67936 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM4P67936 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPM4P67936 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPM4P67936 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPM4P67936 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM4P67936 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPM4P67936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPM4P67936 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TPM4P67936 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TPM4P67936 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPM4P67936 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPM4P67936 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPM4P67936 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPM4P67936 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPM4P67936 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPM4P67936 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPM4P67936 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPM4P67936 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM4P67936 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM4P67936 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM4P67936 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM4P67936 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPM4P67936 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPM4P67936 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM4P67936 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM4P67936 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM4P67936 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM4P67936 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM4P67936 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPM4P67936 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPM4P67936 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPM4P67936 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPM4P67936 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPM4P67936 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPM4P67936 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPM4P67936 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPM4P67936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms