Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS4XP62701 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS4XP62701 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS4XP62701 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms