Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GEMIN4P57678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GEMIN4P57678 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GEMIN4P57678 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms