Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RWDD2BP57060 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RWDD2BP57060 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RWDD2BP57060 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RWDD2BP57060 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2BP57060 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms