Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH11P55287 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH11P55287 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH11P55287 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH11P55287 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH11P55287 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH11P55287 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH11P55287 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH11P55287 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH11P55287 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH11P55287 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH11P55287 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH11P55287 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH11P55287 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH11P55287 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH11P55287 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH11P55287 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH11P55287 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH11P55287 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH11P55287 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH11P55287 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH11P55287 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH11P55287 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH11P55287 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH11P55287 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH11P55287 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH11P55287 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH11P55287 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH11P55287 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH11P55287 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH11P55287 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH11P55287 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH11P55287 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH11P55287 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH11P55287 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH11P55287 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH11P55287 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH11P55287 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH11P55287 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH11P55287 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH11P55287 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH11P55287 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH11P55287 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH11P55287 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH11P55287 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH11P55287 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH11P55287 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH11P55287 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH11P55287 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH11P55287 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH11P55287 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH11P55287 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH11P55287 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH11P55287 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH11P55287 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH11P55287 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH11P55287 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH11P55287 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH11P55287 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH11P55287 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH11P55287 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH11P55287 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH11P55287 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH11P55287 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH11P55287 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH11P55287 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH11P55287 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH11P55287 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH11P55287 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH11P55287 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH11P55287 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH11P55287 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH11P55287 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH11P55287 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH11P55287 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH11P55287 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH11P55287 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH11P55287 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH11P55287 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH11P55287 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH11P55287 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH11P55287 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH11P55287 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH11P55287 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms